Senin, Desember 31, 2012

Alat Pendeteksi DNA Seukuran Flashdisk

Apa yang Anda bayangkan tentang tes DNA? Prosedur rumit, proses medis yang lama, biaya yang besar, mungkin akan terlintas dalam benak Anda. Namun kini telah hadir MinION, DNA sequencer sekali pakai,  yang menggunakan teknologi yang jauh lebih hebat, dan ukurannya hanya sebesar USB Flashdisk. MinION ini mampu sekuensing 100 juta pasangan basa dan hasilnya akan keluar dalam waktu enam jam. Sampel darah utuh, plasma, dan serum yang diterima oleh perangkat untuk analisis langsung dan reagen yang dibutuhkan untuk proses analitik selanjutnya siap untuk digunakan dengan tiap satu unit MinION.
Adalah Oxford Nanopore (ON), perusahaan yang telah mengembangkan teknologi berbasis nanopore untuk sekuensing DNA, RNA, protein, dan rantai molekul panjang lainnya sejak kelahirannya pada tahun 2005. Perusahaan ini baru saja mengumumkan bahwa dalam 6-9 bulan ke depan akan membawa "pasar sequencer protein yang cepat, portabel, dan sekali pakai" yang akan mengubah pandangan tentang proses  sequencing yang menghabiskan biaya modal besar yang terkait dengan peralatan yang diperlukan untuk memasuki lapangan.
Apa itu nanopore? Nanopore adalah molekul organik berpori yang sangat kecil(~ 1-2 nanometer). Nanopore tertanam dalam membran polimer sintetik yang hanya dua molekul ketebalannya. Disebut juga membran lipid bilayer, mirip dengan yang ada di tubuh, tapi membran bilayer tubuh terbukti terlalu rapuh untuk digunakan dalam produksi sequencer. Pengembangannya ini berhasil menghasilkan sejenis membran tipis yang memiliki hambatan listrik yang sangat besar dan cukup kuat untuk digunakan di lapangan pada sebagian besar proyek Oxford Nanopore.
Berbagai macam molekul dapat dideteksi dan diidentifikasi dengan menggunakan pengukuran arus ion nanopore, mulai dari molekul fisiologis atau farmasi kecil untuk protein. Namun, MinION diarahkan untuk sekuensing DNA, sehingga nanopore dan enzim dalam cairan elektrofisiologi dioptimalkan untuk membedakan empat asam amino (adenin, sitosin, guanin, dan timin) yang menyandikan gen dalam DNA. Dalam hasil akhir, tiga asam amino dibaca secara bersamaan oleh nanopore, yang memiliki keahlian untuk membedakan antara 64 kemungkinan kombinasi.
MinION ini telah berhasil digunakan untuk membaca genom dari bakteriofag lambda, sekitar 48500 pasangan basa panjang, dua kali dalam satu proses. Hal ini dilakukan dengan menutup akhir DNA dengan penutupan jepit rambut, sehingga kedua untai dalam genom akan melewati nanopore yang sama. Namun membaca sekitar 100.000 pasangan basa dalam DNA tunggal yang rumit harus tetap menggunakan teknik sekuensing yang lebih tradisional. Jika Anda tertarik memiliki alat canggih ini, Anda harus merogoh kocek sebesar US$ 900.

Sumber : Oxford Nanopore

0 Tanggapan:

Posting Komentar

Contact Us

Kampus I Politeknik Kesehatan Kemenkes Semarang
Jl. Tirto Agung Pedalangan Banyumanik Semarang Kode Pos 50232
Email: whitecampus@ymail.com
Blog : www.ukmwhitecampus.blogspot.com
Twitter : @UKMWhiteCampus